Балл 0

Для данной публикации установлен балл=0 по одной из причин:

  • публикация имеет переводную версию или явлется оригинальной версией переводной статьи c большим рассчитанным баллом
  • публикация не попадает ни под один из критериев для начисления баллов в соответствии с положением
  • публикация вошла в отчеты предыдущих периодов
  • издание каталогизировано постатейно и балл присвоен каждой составной части
  • публикация внесена в базу после 01-01-2019 и не оформлена в соответствии с требованиями института (отсутствует экспертное заключение)
  • публикация не отнесена к гос. заданию(-ям) института

Запись создана: 18-02-2019 12:47
Последнее изменение: 18-02-2019 12:54

CpG Islands' Clustering Uncovers Early Development Genes in the Human Genome

Тип публикации

Статья в журнале

Язык eng
Журнал Computer Science and Information Systems

ISSN: 1820-0214 ; Онлайн ISSN: 2406-1018
Год 2018
Выходные данные Том: 15
Номер: 2
Страницы: 473-485
Авторы
  1. Babenko V. N.
    Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia (ru)
    Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
  2. Bogomolov A. G.
    Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
  3. Babenko R. O.
    Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
  4. Galieva E. R.
    Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
  5. Orlov Yu. L.
    Доп. аффилиация: Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia (ru)
    Доп. аффилиация: Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
DOI 10.2298/CSIS170523004B
Усл. п. л.
Даты Поступила в редакцию: 23.05.2017
Принята к публикации: 30.04.2018
Абстракт We address the problem of the annotation of CpG islands (CGIs) clusters in the human genome. Upon analyzing gene content within CGIs clusters, piRNA, tRNA, and miRNA-encoding genes were found as well as CpG-rich homeobox genes reported previously. Chromosome-wide CGI density is positively correlated with replication timing, confirming that CGIs may serve as open chromatin markers. Early embryonic stage expressed KRAB-ZNF genes abundant at chromosome 19 were found to be interlinked with CGI clusters. We detected that a number of long CGIs and CGI clusters are, in fact, tandem copies with multiple annotated macrosatellites and paralogous genes. This finding implies that tandem expansion of CGIs may serve as a substrate for non-homologous recombination events.
Ключевые слова: CpG islands, bioinformatics, human genome, macrosatellite, genome annotation, genome repeats, DNA methylation
Библиографическая ссылка:
Babenko V. N., Bogomolov A. G., Babenko R. O., Galieva E. R., Orlov Yu. L. CpG Islands' Clustering Uncovers Early Development Genes in the Human Genome // Computer Science and Information Systems. 2018. Vol. 15, no. 2. P. 473-485. DOI: 10.2298/CSIS170523004B
[WoS 0.613/Q4] [SCOPUS 0.229/Q3]
SCOPUS WoS
Оформление публикации не соотвествует внутренним регламентирующим документам
РИНЦ
Статус Нет

SCOPUS
Статус Да
Квартиль Q3
Рейтиг 0.229 (2017)
Ссылка Открыть в SCOPUS
WoS
Статус Да
Квартиль Q4
Импакт-фактор 0.613 (2017)
Ссылка Открыть в WoS
ВАК
Статус Нет

Тэги