Балл 0

Для данной публикации установлен балл=0 по одной из причин:

  • публикация имеет переводную версию или явлется оригинальной версией переводной статьи c большим рассчитанным баллом
  • публикация не попадает ни под один из критериев для начисления баллов в соответствии с положением
  • публикация вошла в отчеты предыдущих периодов
  • издание каталогизировано постатейно и балл присвоен каждой составной части
  • публикация внесена в базу после 01-01-2019 и не оформлена в соответствии с требованиями института (отсутствует экспертное заключение)
  • публикация не отнесена к гос. заданию(-ям) института

Запись создана: 12-08-2018 12:24
Последнее изменение: 19-12-2018 16:44

Филогенетическое разнообразие бактерий цикла серы в донных осадках Херсонесской бухты

Тип публикации

Статья в журнале

Статья с переводом
Переводная статья:
Phylogenetic Diversity of the Sulfur Cycle Bacteria in the Bottom Sediments of the Chersonesus Bay // Microbiology. 2018. Vol. 87, no. 3. P. 372–381
Язык rus
Журнал Микробиология

ISSN: 0026-3656
Год 2018
Выходные данные Том: 87
Номер: 3
Страницы: 279–290
Авторы
  1. Брюханов А. Л.
    Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Москва, Россия (ru)
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
  2. Власова М. А.
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
  3. Малахова Т. В.
  4. Перевалова А. А.
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
  5. Пименов Н. В.
    ФИЦ Биотехнологии РАН, Москва, Россия (ru)
DOI 10.7868/S0026365618030060
Усл. п. л.
Даты Поступила в редакцию: 19.09.2017
Абстракт Черное море - крупнейший меромиктический водоем, в донных осадках которого протекает мощный биогенный процесс образования сероводорода. Целью настоящей работы стало получение данных о филогенетическом разнообразии микроорганизмов цикла серы (сульфатредуцирующих и сероокисляющих бактерий), обитающих в черноморских прибрежных газонасыщенных донных отложениях. Образцы отбирали в Херсонесской (Голубой) бухте в акватории г. Севастополя из белёсых бактериальных обрастаний сульфуретт, а также из верхнего слоя близлежащего грунта. С препаратами ДНК, выделенными из нативных проб и полученных накопительных культур, был проведен ПЦР-анализ с использованием олигонуклеотидных праймеров, специфичных к участкам гена 16S рРНК основных подгрупп сульфатредуцирующих бактерий (СРБ), а также к участкам гена dsrB (восстановительного и окислительного типов), который кодирует β-субъединицу диссимиляционной (би)сульфитредуктазы - ключевого фермента цикла серы, присущего сульфатредуцирующим и сероокисляющим мик­роорганизмам. В пробах ДНК, выделенных из прибрежных донных микробных обрастаний, показано наличие участков гена 16S рРНК, которые характерны для представителей родов Desulfobacterium, Desulfobacter, Desulfococcus-Desulfonema-Desulfosarcina и Desulfovibrio-Desulfomicrobium. Методом денатурирующего градиентного гель-электрофореза (ДГГЭ) с последующим секвенированием реамплифицированных участков гена dsrB было показано, что по аминокислотным последовательностям, кодируемым геном dsrB восстановительного типа, СРБ из прибрежных газонасыщенных донных осадков Черного моря имели наибольшую гомологию (92-99%) с геном dsrB культивируемых СРБ родов Desulfovibrio, Desulfatitalea, Desulfobacter, Desulfobacterium. Выявлена также высокая гомология с некультивируемыми штаммами СРБ из различных морских местообитаний, в частности, из донных осадков Северного и Японского морей. Аминокислотные последовательности, кодируемые геном dsrB окислительного типа, обладали наибольшей гомологией (90-99%) к соответствующему гену представителей сероокисляющих бактерий родов Thiocapsa, Thiobaca, Thioflavicoccus и Thiorhodococcus.
Ключевые слова: cульфатредуцирующие бактерии, сероокисляющие (тионовые) бактерии, Черное море, донные осадки, микробные маты, сообщества микроорганизмов, диссимиляционная (би)сульфитредуктаза, ген dsrB
РИНЦ SCOPUS ВАК Гос. задание

РИНЦ
Статус Да
Импакт-фактор 1.489 (2017)
Ссылка Открыть в e-library
SCOPUS
Статус Да
Квартиль Q4
Рейтиг 0.150 (2017)
Ссылка
WoS
Статус Нет

ВАК
Статус Да

Публикация отнесена к гос.заданию:
0828-2018-0001 (АААА-А18-118020890090-2) «Молисмологические и биогеохимические основы гомеостаза морских экосистем»

Тэги