База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@marine-research.org

Дата внесения публикации в базу 02-11-2018 08:24 не попадает в период стимулирования 01-09-2019 – 31-08-2020
Статья в периодическом издании

An analysis of IS630/Tc1/mariner transposons in the genome of a Pacific oyster, Crassostrea gigas

WoS 1.957/Q3 SCOPUS 0.911/Q3
DOI 10.1007/s00239-018-9868-2
Язык Английский
Журнал Journal of Molecular Evolution

ISSN: 0022-2844; Онлайн ISSN: 1432-1432
Год 2018
Выходные данные Том: 86, Выпуск: 8, Страницы: 566-580
Авторы
  1. Puzakov M. V. (Puzakov M. V.)
  2. Puzakova L. V. (Puzakova L. V.)
  3. Cheresiz S. V.
    Department of Medicine, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
    State Scientific Research Institute of Physiology and Basic Medicine, Novosibirsk, Russia (ru)
Даты Поступила в редакцию: 19.01.2018
Принята к публикации: 28.09.2018
Опубликована онлайн: 03.10.2018
Абстракт Transposable elements represent the DNA fragments capable of increasing their copy number and moving within the genome. Class II mobile elements represents the DNA transposons, which transpose via excision and the subsequent reinsertion at random genomic loci. The increase of their copy number occurs only when the transposition event is coupled with the replication. IS630/Tc1/mariner DNA transposon superfamily is one of the largest and widely distributed among the Class II elements. In this work, we provide a detailed analysis of IS630/Tc1/mariner DNA transposons from the Pacific oyster, Crassostrea gigas. IS630/Tc1/mariner transposons represented in the genome of the Pacific oyster belong to four families, Tc1 (DD34E), mariner (DD34D), pogo (DDxD), and rosa (DD41D). More than a half of IS630/Tc1/mariner elements from C. gigas belong to Tc1 family. Furthermore, Mariner-31_CGi element was shown to represent a new and previously unknown family with DD37E signature. We also discovered the full-size transcripts of eight elements from Tc1, mariner, and pogo families, three of which can, presumably, retain their transposition activity.
Ключевые слова: Transposable elements, IS630/Tc1/mariner, Transposon activity, Pacific oyster, Mollusca
URL https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00239-018-9868-2

Запись создана: 02-11-2018 08:24
Последнее изменение: 15-01-2019 16:38

Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Cheresiz S. V. An analysis of IS630/Tc1/mariner transposons in the genome of a Pacific oyster, Crassostrea gigas // Journal of Molecular Evolution. 2018. V. 86, iss. 8. P. 566-580. DOI: 10.1007/s00239-018-9868-2
[WoS 1.957/Q3][SCOPUS 0.911/Q3]
Экспертное заключение: –
Индексация:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.957/Q3 (2017)
Идентификатор
000447385700006
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
0.911/Q3 (2017)
Идентификатор
2-s2.0-85054547018
РИНЦ
Статус
Нет
Идентификатор

В публикации указано госзадание:
Тема АААА-А18-118021490093-4 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом»