База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@marine-research.org

Число соавторов публикации - 4
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в WEB of Science (WoS) - Q2 - Формула: 20/корень квадратный из Nавторов = 20/корень квадратный из 4 (2) = 10
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q1 - Формула: 12/корень квадратный из Nавторов = 12/корень квадратный из 4 (2) = 6
Количество соавторов публикации - 4
Публикации в изданиях, индексируемых в Web of Science Core Collection: Q2, K=10
  • Пузаков М. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(4*1) = 2.5
  • Пузакова Л. В.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 10/(4*1) = 2.5
Статья в периодическом издании

The IS630/Tc1/mariner transposons in three ctenophore genomes

WoS 4.286/Q2 SCOPUS 1.612/Q1
DOI 10.1016/j.ympev.2021.107231
Язык Английский
Журнал Molecular Phylogenetics and Evolution

ISSN: 1055-7903; Онлайн ISSN: 1095-9513
Год 2021
Выходные данные Том: 163, Статья: 107231, Страниц (электронный ресурс): 11
Авторы
  1. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  2. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
  3. Cheresiz S. V.
    V. Zelman Institute for Medicine and Psychology, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
    State Scientific Research Institute of Physiology and Basic Medicine, Novosibirsk, Russia (ru)
  4. Sang Y.
    College of Animal Science & Technology, Yangzhou University, Yangzhou, China (cc)
Даты Поступила в редакцию: 02.02.2021
После доработки 31.05.2021
Принята к публикации: 11.06.2021
Опубликована онлайн: 13.06.2021
Абстракт Transposable elements (TEs) exert a significant effect on the structure and functioning of the genomes and also serve as a source of the new genes. The study of the TE diversity and evolution in different taxa is indispensable for the fundamental understanding of their roles in the genomes. IS630/Tc1/mariner (ITm) transposable elements represent the most prevalent and diverse group of DNA transposons. In this work, we studied the diversity, evolutionary dynamics and the phylogenetic relationships of the ITm transposons found in three ctenophore species: Mnemiopsis leidyi, Pleurobrachia bachei, Beroe ovata. We identified 29 ITm transposons, seven of which possess the terminal inverted repeats (TIRs) and an intact transposase, and, thus, are, presumably, active. Four other ITm transposons have the features of domesticated TEs. According to the results of the phylogenetic analysis, the ITm transposons of the ctenophores represent five groups – MLE/DD34D, TLE/DD34-38E, mosquito/DD37E, Visiror/DD41D and pogo/DDxD. Pogo/DDxD superfamily turnes out to be the most diverse and prevalent, since it accounts for more than 40% of the TEs identified. The data obtained in this research will fill the gap of knowledge of the diversity and evolution of the ITm transposons in the multicellular genomes and will lay the ground for the study of the TE effects on the evolution of the ctenophores.
Ключевые слова: IS630/Tc1/mariner , transposable elements, Mnemiopsis leidyi, Pleurobrachia bachei, Beroe ovata, Ctenophores
URL https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790321001640

Запись создана: 15-07-2021 16:21
Последнее изменение: 16-07-2021 09:36

Текущий статус издания
Molecular Phylogenetics and Evolution
ISSN: 1055-7903
E-ISSN: 1095-9513
WoS: Q2

SCOPUS: Q1

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Cheresiz S. V., Sang Y. The IS630/Tc1/mariner transposons in three ctenophore genomes // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2021. Vol. 163. Article no. 107231 (11 p.). DOI: 10.1016/j.ympev.2021.107231
[WoS 4.286/Q2][SCOPUS 1.612/Q1]
Экспертное заключение: № 257, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
4.286/Q2 (2020)
Идентификатор
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.612/Q1 (2020)
Идентификатор
РИНЦ
Статус
Нет
Идентификатор

В публикации указано госзадание:

Тема № 121041400077-1 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом» (предыдущий номер АААА-А18-118021490093-4)