База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@marine-research.org

Дата внесения публикации в базу 22-01-2021 09:45 не попадает в период стимулирования 01-12-2021 – 31-11-2022
Количество соавторов публикации - 2
Публикации в изданиях, индексируемых в SCOPUS и не индексируемых в Web of Science, K=1
  • Корнийчук Ю. М.: количество аффилиаций - 1, вклад в КБПР публикации:
    формула: K/(Nсоавторов*Nаффил) = 1/(2*1) = 0.5
Статья в периодическом издании

Генотипирование черноморских трематод семейства Opecoelidae по митохондриальным маркерам

SCOPUS –/– РИНЦ 0.487
DOI https://doi.org/10.21072/mbj.2020.05.4.02
Язык Русский
Журнал Морской биологический журнал

ISSN: 2499-9768; Онлайн ISSN: 2499-9776
Год 2020
Выходные данные Том: 5, Номер: 4, Страницы: 15-27
Авторы
  1. Катохин А. В.
    ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск (ru)
  2. Корнийчук Ю. М.
Даты Поступила в редакцию: 01.08.2020
После доработки 18.12.2020
Принята к публикации: 25.12.2020
Опубликована онлайн: 30.12.2020
Абстракт Opecoelidae Ozaki, 1925 (Trematoda: Opecoeloidea) — ведущее по числу видов и родов семейство трематод в Чёрном море. Мариты наиболее распространённых видов черноморских опецелидных трематод подробно описаны морфологически, однако сведения о структуре их геномов отрывочны, а данные о митохондриальных геномах отсутствуют полностью. Цель исследования — получить первые сведения о строении участков митохондриального генома представителей наиболее распространённых в Чёрном море в современный период родов трематод семейства Opecoelidae для последующего уточнения их таксономического статуса. Филогенетические отношения внутри анализируемой части этого семейства реконструированы на основе данных, полученных нами, и соответствующих данных из GenBank с помощью алгоритма Maximum Likelihood и модели нуклеотидных замен HKY. Для укоренения филогенетического дерева использованы соответствующие последовательности Brachycladium goliath (Brachycladioidea: Brachycladiidae). Поскольку последовательности CO1 — стандартного и наиболее популярного митохондриального маркера — для исследуемых родов опецелид до сих пор не были известны, нами на основе известных соответствующих последовательностей Xiphidiata разработаны праймеры для амплификации фрагмента CO1, чтобы впервые провести соответствующий филогенетический анализ. Впервые определены и депонированы в GenBank нуклеотидные последовательности фрагментов митохондриальных генов CO1 и 16S черноморских трематод Cainocreadium flesi Korniychuk & Gaevskaya, 2000, Gaevskajatrema perezi (Mathias, 1926) Gibson & Bray, 1982 и Helicometra fasciata (Rudolphi, 1819) Odhner, 1902 от разных видов дефинитивных хозяев — рыб. У C. flesi не выявлено специфичных к окончательным хозяевам — рыбам линий по структуре фрагмента митохондриального гена CO1, однако отмечено высокое CO1-нуклеотидное разнообразие. У марит черноморских H. fasciata определена приуроченная к зеленушкам-руленам Symphodus tinca CO1-гаплогруппа, статус которой требует дальнейшего выяснения; необходимы экологические и генетические исследования предполагаемого видового комплекса H. fasciata из разных акваторий. При анализе последовательностей фрагмента митохондриального гена 16S рРНК гостальных генетических линий у H. fasciata выделить не удалось. У черноморских G. perezi не обнаружено значительных различий по фрагменту 16S между трематодами из окончательных хозяев разных видов, однако внутривидовое 16S-нуклеотидное разнообразие оказалось высоким.
Ключевые слова: Чёрное море, Trematoda, Opecoelidae, Cainocreadium, Gaevskajatrema, Helicometra, митохондриальныегены, CO1, 16SрРНК
URL https://mbj.marine-research.org/article/view/262

Запись создана: 22-01-2021 09:45
Последнее изменение: 15-11-2021 16:04

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Катохин А. В., Корнийчук Ю. М. Генотипирование черноморских трематод семейства Opecoelidae по митохондриальным маркерам // Морской биологический журнал. 2020. Т. 5, № 4. С. 15-27. https://doi.org/10.21072/mbj.2020.05.4.02
[SCOPUS –/–][РИНЦ 0.487]
Экспертное заключение: № 11, 2021
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Нет
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
–/– (–)
Идентификатор
2-s2.0-85100432871
РИНЦ
Статус
Да
Импакт-фактор (год)
0.487 (2019)
ID
44581662
EDN

В публикации указано госзадание:

№ 121030100028-0 «Закономерности формирования и антропогенная трансформация биоразнообразия и биоресурсов Азово-Черноморского бассейна и других районов Мирового океана» (предыдущий номер АААА-А18-118020890074-2)

Тэги:
ЦКП Коллекция гидробионтов Мирового океана