База результатов деятельности
научных работников ФИЦ ИнБЮМ
Научно-информационный отдел ФИЦ ИнБЮМ
+7 8692 54-55-50
sci-info@marine-research.org

Число соавторов публикации - 3
Целевой показатель госзадания:
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в WEB of Science (WoS) - Q2 - Формула: 20/корень квадратный из Nавторов = 20/корень квадратный из 3 (1.7321) = 11.55
  • Рецензируемые научные статьи в периодических журналах, индексируемых в SCOPUS - Q1 - Формула: 12/корень квадратный из Nавторов = 12/корень квадратный из 3 (1.7321) = 6.93
Статья в периодическом издании

The Tc1-like elements with the spliceosomal introns in mollusk genomes

WoS 2.879/Q2 SCOPUS 1.095/Q1
DOI 10.1007/s00438-020-01645-1
Язык Английский
Журнал Molecular Genetics and Genomics

ISSN: 1617-4615; Онлайн ISSN: 1617-4623
Год 2020
Выходные данные Том: 295, Выпуск: 3, Страницы: 621-633
Авторы
  1. Пузаков М. В. (Puzakov M. V.)
  2. Пузакова Л. В. (Puzakova L. V.)
  3. Cheresiz S. V.
    V. Zelman Institute for Medicine and Psychology, Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia (ru)
    State Scientific Research Institute of Physiology and Basic Medicine, Novosibirsk, Russia (ru)
Даты Поступила в редакцию: 29.07.2019
Принята к публикации: 09.01.2020
Опубликована онлайн: 23.01.2020
Абстракт Transposable elements (TEs) are DNA sequences capable of transpositions within the genome and thus exerting a considerable influence on the genome functioning and structure and serving as a source of new genes. TE biodiversity studies in previously unexplored species are important for the fundamental understanding of the TE influence on eukaryotic genomes. TEs are classified into retrotransposons and DNA transposons. IS630/Tc1/mariner (ITm) superfamily of DNA transposons is one of the most diverse groups broadly represented among the eukaryotes. The study of 19 mollusk genomes revealed a new group of ITm superfamily elements, which we henceforth refer to as TLEWI. These TEs are characterized by the low copy number, the lack of terminal inverted repeats, the catalytic domain with DD36E signature and the presence of spliceosomal introns in transposase coding sequence. Their prevalence among the mollusks is limited to the class Bivalvia. Since TLEWI possess the features of domesticated TE and structures similar to the eukaryotic genes which are not typical for the DNA transposons, we consider the hypothesis of co-optation of TLEWI gene by the bivalves. The results of our study will fill the gap of knowledge about the prevalence, activity, and evolution of the ITm DNA transposons in multicellular genomes and will facilitate our understanding of the mechanisms of TE domestication by the host genome.
Ключевые слова: transposable elements, Tc1-like elements, genome evolution, mollusks, intronization, molecular domestication
URL https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-020-01645-1

Запись создана: 09-05-2020 11:10
Последнее изменение: 01-09-2020 11:21

Текущий статус журнала
Molecular Genetics and Genomics
ISSN: 1617-4615
E-ISSN: 1617-4623
WoS: Q3

SCOPUS: Q1

Страница журнала в E-library
Библиографическая ссылка:
Puzakov M. V., Puzakova L. V., Cheresiz S. V. The Tc1-like elements with the spliceosomal introns in mollusk genomes // Molecular Genetics and Genomics. 2020. Vol. 295, iss. 3. P. 621-633. DOI: 10.1007/s00438-020-01645-1
[WoS 2.879/Q2][SCOPUS 1.095/Q1]
Экспертное заключение: № 570, 2020
Индексация на момент включения в базу:
Web of Science
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
2.879/Q2 (2018)
Идентификатор
000544759100006
SCOPUS
Статус
Да
Импакт-фактор/Квартиль(год)
1.095/Q1 (2018)
Идентификатор
2-s2.0-85078336339
РИНЦ
Статус
Нет
Идентификатор
43246079

В публикации указано госзадание:
Тема АААА-А18-118021490093-4 «Функциональные, метаболические и токсикологические аспекты существования гидробионтов и их популяций в биотопах с различным физико-химическим режимом»